1997年，巴基斯坦政府将坎西引渡给美国警方，因为他于1993年在美国中央情报局总部外杀死了两名中央情报局人员。《华盛顿邮报》报道说，巴基斯坦官员对于欧登的被捕感到非常高兴，总理谢里夫还对有关人员表示祝贺。然而他的祝贺并没有公开，以免引起非议。
巴基斯坦政府可能还考虑到，如果拉登是大使馆爆炸案的幕后主使的话，巴基斯坦国内的拉登支持者会因政府的亲美行为而爆发反政府暴乱。美国政府显然也考虑到了这一层，因此已将驻巴基斯坦的一些外交人员撤走，并警告美国人尽量避免到巴基斯坦旅游，以免成为恐怖主义分子攻击的目标。
如果美国要求在巴基斯坦境内对阿富汗发动攻击的话，巴基斯坦政府将处于两难境地。
华盛顿一再重申恐怖分子手上沾满了美国人的鲜血，他们一定不能逃脱惩罚。为使其不成为空洞的威胁之语，几十年来，美国也倾其全力在世界范围内搜捕恐怖分子并成绩斐然。
即使没有欧登的供词，对拉登不利的证据也越来越多。《华盛顿邮报》引用美国中央情报局前情报官员坎里斯，塔罗的话说，他们截取了大使馆爆炸案发生后拉登与其同伙的电子邮件，在里面他们彼此表示了热烈的祝贺。
同时，美国情报部门获悉，8月7日爆炸案发生后，拉登在阿富汗的恐怖组织训练营地立即疏散一空。这个训练营地隐藏在深山老林里，大约有几十人。
然而即使最后证明拉登与恐怖活动有关，华盛顿又能如何呢？拉登目前有许多忠实的追随者，他们日夜不停地在阿富汗的深山中保护着他，美国对此鞭长莫及。一些美国官员担心如果拉登真的是恐怖分子的头目，而又无法将他缉拿归案，势必会对未来的反恐怖主义行动产生很大影响。
如果媒体报道属实的话，美国安全人员曾试图缉拿拉登但未获成功，而塔利班又不可能把拉登交给美国。塔利班发言人说：“拉登是伊斯兰人民的客人，我们不能把他引渡给任何人。”如此中立的“外交”言辞，看来只有军事行动才能解决问题了。
显然，在这个日渐复杂的事件中，美国要做的第一步就是真正确定爆炸案幕后主使者的身份及其目的。
据《华盛顿邮报》报道，美国情报部门也开始调查，爆炸案是否是一种报复行为的可能性。今年6月，美国和阿尔巴尼亚的安全人员联手对伊斯兰恐怖组织的老巢发动突然袭击。阿尔巴尼亚警方逮捕了两名拉登的手下，美国则获取了一大迭文件和电脑装备。。因此有人揣测，炸弹攻击美国驻肯尼亚和坦桑尼亚大使馆也许是恐怖分子进行的报复行动。当时，阿尔巴尼亚官方对本国一家大报泄漏消息说：“中央情报局在袭击中起了显著作用。”
《华盛顿邮报》也报道：“两周后对恐怖分子的另一次袭击中，另两名嫌疑犯被逮捕。华盛顿再也不可能否认它曾参与此次行动。”
美国大使馆爆炸事件发生在这两次行动之后，这使得美国官员着手调查，这是否是拉登的组织对中央情报局协助逮捕了他们4名成员的报复行动。
此外，美国情报人员分析，由于去年中央情报局人员潜入恐怖分子的巢穴并成功截取了他们计划袭击美国大使馆的情报，因而挫败了两起企图对美国大使馆发动的袭击，同时情报人员自1993年以来还协助捕获了40名恐怖主义嫌疑犯。这也许是促使恐怖主义首脑选择内罗毕和达累斯萨拉姆作为袭击目标的原因，因为这两处都被美国情报机构认为是最不可能遭受袭击的地方。
在华盛顿，政府对源自非洲的恐怖活动掉以轻心，除苏丹之外，他们认为其他的都“不值一晒”。
一位中情局官员说：“如果分一到十级，非洲只是一级。”
而且，非洲本身也不是个稳定的地方。卢旺达或布隆迪的胡图族流亡分子就亟想向在他们的图西族敌人背后撑腰的美国人捣几拳，他们也有炸大使馆的动机。恐怖者的立场
爆炸案发生后，不少组织宣称对这起爆炸案负责。有人宣称内罗毕的爆炸案的罪犯是两名麦加男子，而达累斯萨拉姆爆炸案是埃及人干的。另有声明称：“伊斯兰圣殿解放军以神圣的卡巴的名义宣布对内罗毕的爆炸案负责。”而另一份声明则称他们是“来自世界各国的伊斯兰神圣斗士，”为了报复美国军队占领伊斯兰在阿拉伯半岛的神圣领土而炸毁了美国在达累斯萨拉姆的大使馆。
到8月7日为止，有3个伊斯兰极端组织宣称对两起爆炸事件负责。这3个团体都是过去不为人所知的伊斯兰极端组织，这很可能是假名，目的是为了迷惑调查人员。这3个团体的名称分别为：“阿尔。阿克萨团体”、“麦加人团体”和具有神秘色彩的“伊斯兰圣殿解放军”。
这3个组织分别通过匿名电话向阿拉伯新闻记者宣称对爆炸事件负责，但却没有提供任何细节。因此，调查人员很难判断它们究竟是什么性质的组织。
“伊斯兰圣殿解放军”宣称对美国大使馆的爆炸事件负责，并开出一系列条件。在送往法国国际广播电台和法新社开罗分局的发言中，这个团体要求美国军队撤出沙特，并释放被捕的伊斯兰武装分子。
“伊斯兰圣殿解放军”的要求还包括：美国军队和美国人全部离开沙特；释放扣押在美国。以色列和沙特的伊斯兰人，特别是在狱中的首脑拉赫曼；美国停止对以色列的帮助；取消对穆斯林国家的所谓“制裁”；停止剥夺伊斯兰国家的财富，特别是石油资源等等。
这个团体宣称，由于美国占领了阿拉伯半岛的圣地，因此他们有理由向美国进行圣战。它将“一如既往地追踪美国势力，并打击美国在任何地方的利益，直到美国满足我们的条件。”它还称，灵感“来自于穆斯林的神学家们，包括首脑拉赫曼和首脑拉登的言论。”
其他相似的声明也被送往法国国际广播电台和伦敦的阿拉伯报纸。据报道，发出声明的有本·拉登、埃及吉哈得首领和其他一些恐怖主义团体。但声明的真实性均不得而知。
国际反恐怖主义研究院院长鲁门帕兹评论说：“以匿名或刚刚捏造的名字宣称对某事件负责是各种各样的穆斯林武装组织多年来采取的一种策略，目的是为了掩盖元凶的真实身份，或源于敌对穆斯林团体间的相互攻击，甚至有的团体以这样的方法来增加知名度，或表示对某事件的立场。
“从目前的情况来看，两起爆炸事件极有可能是阿富汗极端分子和埃及吉哈得联手策划实施的。最近，这些团体联合成立了一个名为“伊斯兰反犹太人和十字军国际阵线”，并在1998年2月的一个记者招待会上发表了联合宣言。宣言是由沙特流亡的亿万富翁拉登、埃及吉哈得的一名流亡首领。巴基斯坦和孟加拉激进分子团体的首领共同发布的。他们同时还发表了两条伊斯兰法令，宣布对美国的圣战，要求所有的穆斯林无论在何时何地都要“杀死美国人、美国兵和他们的同谋，并卷走他们的钱财。”
流亡于伦敦的埃及伊斯兰武装激进分子在1998年8月接受伦敦的一家沙特报纸采访时，透露了有关恐怖主义组织的一些内幕。
埃及人卷人两起爆炸事件，还可以从另外一则关于埃及吉哈得的消息中看出。1998年8月5日，驻开罗记者在报纸上公开了一天前一名埃及吉哈得分子给他的纸条上的内容。在纸条上，这个组织威胁说要袭击美国人，目的是为了报复美国帮助引渡了4名在阿尔巴尼亚被捕的埃及穆斯林武装分子。阿尔巴尼亚警方是在得到美国情报机构提供的线索后将他们逮捕的，井迫于美国的压力将4人移交给埃及警方。
值得注意的是，伊朗官员与埃及发言人一样也强烈谴责了爆炸事件的发生。另外一些重要的穆斯林组织，如“哈马斯”和“核茨巴拉”，则到目前为止保持缄默。”
爆炸案后，哈马斯首脑严森8月11日在官方英特网上发表声明说，他对于发生在内罗毕和达累斯萨拉姆美国大使馆爆炸事件中嫌疑犯的身份毫不知情。然而，他认为爆炸是一种正当的自我防卫。
他说：“美国一向把自己置身于犹太人反阿拉伯和穆斯林世界的一边，因此对于有人报复美国不公平的政策的举动也就不足为奇了。东非的爆炸袭击是那些想报复美国不公政策对他们国家造成损害的自我防卫。”
严森强调，哈马斯对嫌疑犯一无所知，而且哈马斯与拉登也没有任何关系。严森还攻击了美国情报人员，他说：“他们根本没有认清谁是他们的敌人。”
严森在声明中说：“哈马斯不想袭击美国。我们的战斗在巴勒斯坦的土地上。我们不会将战斗扩展到巴基斯坦以外，因为这不符合我们的目标而且对我们的人民毫无益处。”
严森还宣布：“哈马斯最近没有对以色列发动攻击，这不是因为我们的意识转变了，而是考虑到我们的斗士在战场上遇到的特殊情况，是因为美国和以色列情报机构和巴基斯坦官方对我们的联合攻击。哈马斯决不会丢下武器投降，它将一如既往的把自己奉献给吉哈得。”
另一个恐怖主义组织“国际伊斯兰阵线”则发表了声称要继续与伊斯兰的敌人作战的檄文。宣言的题目是：“美国，我们要你还债。”宣言写道）
“我们，阿尔—木哈及柔对于在坦桑尼亚的达累斯萨拉姆和肯尼亚的内罗毕大使馆爆炸中丧生的无辜市民表示哀悼，同时也为这两次行动大声叫好。