除了债卷这笔及时的战争财政保障，因天京沦陷逃亡到根据地的那些太平天国大小王爷也成了根据地财神爷。太平天国毕竟是落后的农民起义，与洪仁煌教旃木蠖嗍跻谡迫ㄖ蠖际悄芾叹屠蹋荒芾糖x桨偌埔惨胧裁凑懈阋樱庑┤嗽谔油龅氖焙虮梢圆还埽掀趴梢远簦笈囊尤词峭蛲虿荒苌俚摹u庑┤颂藕樾闳牧礁鲂《拥搅烁又荩追滓郧谕趺遄愿鞯囟矗伤淙皇乔谕酰鞘滞飞先疵皇裁幢挥写蟀呀鹨楸Αj繁14跽庑┤私罅坎聘淮搅烁莸亓15叹痛蚱鹆怂侵饕猓谟牒槿诗、容闳商量后，以“劝说”的形式让这些王爷将绝大多数财产都拿了出来，至于怎么拿，他们可以将财产放到银行，以后每年吃利息过日子，也可以将财产放进专门成立的资金管理委员会，在委员会监督下投资工厂、商铺，委员会的成员吸纳了几名比较主动并且在太平天国中有一定声望的王爷，如章王林绍璋。当然，并不是所有王爷都愿意把家产掏出来的，在廉政局局长倪峰的谆谆告诫下他们还是心甘情愿地将财产掏了出来（只是倪峰从此耳边经常有人提醒他某某人在什么时间、什么地点发誓有朝一日一定要给他一点颜色瞧瞧）——不要以为倪峰又动用了他的特务手段，威逼利诱下才让王爷掏了出来，这次倪峰只是在反贪污，反受贿的口号下镇压了几个根据地搜刮民脂民膏的反面典型，本来与这些王爷没什么关系，何况倪峰还保证他们只要遵纪守法，根据地将绝对保障他们人身财产安全，可谁想到他们居然会如此敏感呢？
对待没兵投奔过来的还简单些，何况让他们当了“资本家”后，在经过一段时间，这些王爷拿到了第一笔回报，他们对根据地的怨言大大减少了。对带兵过来的那些王爷处理起来就麻烦了许多。这些王爷过来后一个个都要求待遇，提出老子在某某年就已经参加了太平军，现在过来辅佐幼天王了，怎么着也不能削自己的兵，少自己的一份粮，同时还要求更换武器、给予资金。不行他们就桌子一拍，大喊要占山为王，打家劫舍去了。
对待这样的王爷，史秉誉认为兵是一定要交出来的，这些王爷让他们冲锋不足，投降倒是有术，搞不好什么时候在战场上突然提出无理要求，你要不答应他们立刻此处不留爷自有留爷处跑到敌人那边去了，何况他们不同于战场上起义的清军将领，如程学启、黄翼升，起义过来的这些将领你让他们到学院里面学习，他们二话不说背起行囊就过去，毕竟他们知道在人屋檐下哪能不低头的道理。可王爷们就不同了，这些人自我感觉良好，你让他们上学读书，还不如叫他们上吊来的痛快，改造太平天国的王爷可比改造清军将领难多了！
带兵不成，这兵是一定要削减的，只是在削减上要动一番脑筋。为了削减太平天国王爷们的手下，在召开无数次讨论会后，政府做出了凡是太平天国带兵过来的王爷，只要他们将一名士兵交给政府，那么政府就奖赏他们十两银子。见钱眼开的这些王爷发觉卖兵来钱很快，纷纷将自己手头的士兵交了出来，同时流落各地打野草的王爷知道消息后也赶了过来，一心以手下换取金钱，自己好安心当寓公。只是这些人贪心不已，为了能多从政府那边骗取银两，很多王爷在过来路上大肆抓丁拐口，以百姓充数。史秉誉发现苗头不对，很快又更改了政策，改成将合格的士兵、并且士兵没有投诉自己是被骗被拐交给政府才能领取奖金。不然不光奖金不能领取，还要追究他拐骗人口的罪行。在抓了几名人口贩子后，这股歪风才算告一段落。
不肯归附的王爷也有，有少数几个王爷习惯了四处打草谷，不愿意将自己的手下交给政府。对待这种王爷史秉誉认为应该坚决镇压。为了镇压他们史秉誉在和杨沪生商量后调左宗棠的南方集群进行清剿土匪。——杨沪生认为在自己根据地中四处流窜，到处打家劫舍，这不是土匪是什么？——左宗棠南方集群底子是楚军与淮军，这些部队战斗力强悍，并且左宗棠、程学启、王德榜、刘松山、刘锦棠都是身经百战有勇有谋的帅才、将才。在保家卫乡的口号下，四处流窜的那些王爷纷纷落网。他们毕竟以前都参加过太平天国起义，在落网后杨沪生网开一面，并没有将他们全部杀了，只是杀了其中几个民愤特别大的，至于其他的在财产充公后，均关进大牢，算是保留一条性命了。只是用左宗棠剿灭这些流窜的前王爷在赣州太平天国投奔过来人们心目中留下了不好的印象，左宗棠以前毕竟与太平军进行过浴血撕杀的，可以说左宗棠双手沾满了太平军将士的鲜血，今天他竟然又再次对自己以前同胞挥舞起屠刀，而且还杀的特别凶狠，只要投降稍微晚一点，脖子上的脑袋马上就落地了，这些王爷自然心中大为不忿了。
左宗棠可不管那些以前的所谓王爷心里怎么想，左宗棠的眼角高的很，他也不可能看到王爷看自己的眼神简直是在朝外面喷火。他认为现今世界，除了上天派下来的俩位神人外，就数自己这个“今亮”最英明了。那些所谓的王爷不过猪狗之辈，有什么好理会的？
左宗棠的心情现在正好到了几点。在剿灭了流窜在根据地内部的大小土匪后，他的三个旅部队升级了，编成十一到十三师——绝对主力师！每个师都有两个旅，每旅下辖三个团，在师一级部队中还编有炮兵团、驮马团、机枪营……等辅助部队，全师共有一万八千人。以前三个旅长现在都成了响当当的少将师长，至于自己，解放军副司令的名头还在，同时杨首长又把自己暨原属南方集群的三个师调到浙江、赣东北、皖南一线，自己成了东方战区司令员，整个战区负责浙江、安徽、江西东北、福建、广东，指挥的部队不光有十一到十三师，还有李世贤正在整编的两个主力师（十四、十五师，师长分别是黄呈忠、范汝增）、陆战旅等部队，可以说根据地半壁江山三分之一的军队由自己全权负责。
李世贤部队在进攻过绩溪后就撤回浙江进行休整了，在精简兵员，改善武器，建立了政治工作制度，部队将领成批到军校进行短期学习，同时又补充了大量军事、政治学校毕业学员后，到了半年后这支部队与左宗棠以前部队一样，除了最高层主将没有更改，其他一点以前痕迹都没有了。并且下级全部换了一遍，可以说李世贤就是突然想反悔，他除了自己连一个士兵也不可能带走。在七月份李世贤的部队进行了整编，十万大军只保留了三万六千人，编成两个主力师，其他人要么到湖南种庄稼，要么到广东当工人，还有部分素质比较好的编入到其他主力部队中去。改编后南方集群与东方集群的编制被撤消，两个集群合编成解放军第三集团军。
根据地在通过香港进行货物进出口后，因为有了充足的原材料，军工厂很快恢复了原有的生产速度，并且极大地提高了武器装备的生产能力。这方面从美国过来的赫尔做出了杰出的贡献，在过来时，他的家族将大批生产工具走私过来，在安装后，很快就投入了生产，为此赫尔荣获了根据地颁发的银质杰出贡献奖章。
有了充足的弹药，部队的扩充就有了保障。现在根据地拥有长江以南半壁江山，人口达到一亿两千余万，加之太平天国王爷将自己的士兵“卖”给了政府，在合格兵员方面根据地用不着发愁。到了七月，除了将李世贤的部队改编成两个师，杨沪生同时还将自己的两个军编成两个集团军，五个主力师扩大为五个军，下辖十个师，以前的旅长都成了师长。至于机动旅，在改编后编成八个乙种师，乙种师每师只辖三个团，在支援重武器方面不如主力师。
调到湖南的荣一师改编略晚于其他部队，不过在扩充后荣一师成了模范军，下辖三个模范师，他的编制、规模、武器装备均远远好于其他部队，其他各师只装备了一个多管机枪营，而每个模范师却配备了一个水冷式机枪连，其他师还有大量的前装火炮，而模范师已经完全后装线膛化了。
石达开的西方集群改编最晚，过程也最复杂。石达开的部队毕竟没有经受过西方军队战斗洗礼，他的部队中除了抬枪、火枪，大量的武器还是原始的大刀长矛，对新式武器他们不向左宗棠、李世贤心情那么急迫。同时石达开虽然加入了解放军，可他对解放军中那一套还是心有疑虑的，石达开认为所谓的政委制度，这是杨沪生、史秉誉剥夺自己掌握军权的一种把戏——例子是有的，赣州那些整天无事可做、醉生梦死的前王爷就是接受了政委后所得到的回报，也许这些王爷喜欢过这种花天酒地、无忧无虑的日子，可这决不是他石达开。于是杨沪生再三要求石达开将部队完全解放军化，可每次都被石达开婉言谢绝了，不光政委制度，根据地其他地方官员制度在石达开控制区同样得不到贯彻实施，四川一时仿佛成了石达开的独立王国。
对石达开杨沪生还是比较客气。毕竟人才难得，有些事情杨沪生也就睁只眼闭只眼，只要石达开能按照要求，在战略上与其他各战区紧密配合，杨沪生也就觉得心满意足了。
石达开虽然兵多将广，可杨沪生也知道他的那些兵并非强到让自己害怕的地步。与赖汉英会师后石达开部队达到了四十万，但这支部队光靠四川粮食是远远不能养活的，还必须从湖南朝石达开供应粮食。